Hi,
I am trying to install q2studio interface but I get the following error. Can you please suggest what I’m doing wrong. Sorry for the very lengthy script but I have pasted all of the errors for your reference.
Many thanks in advance.
inflating: q2studio-2017.10.0/test/test_helper.js
(qiime2-2017.10) [email protected]:/mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial$ cd q2studio-2017.10.0/
(qiime2-2017.10) [email protected]:/mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0$ pip install .
Processing /mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): q2studio==2017.10.0 from file:///mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0 in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages
Requirement already satisfied: click in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: flask in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: gevent in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: qiime2==2017.10.* in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: Jinja2>=2.4 in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from flask->q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: itsdangerous>=0.21 in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from flask->q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: Werkzeug>=0.7 in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from flask->q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: greenlet>=0.4.10 in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from gevent->q2studio==2017.10.0)
Requirement already satisfied: MarkupSafe>=0.23 in /home/tmad109/miniconda2/envs/qiime2-2017.10/lib/python3.5/site-packages (from Jinja2>=2.4->flask->q2studio==2017.10.0)
Building wheels for collected packages: q2studio
Running setup.py bdist_wheel for q2studio ... done
Stored in directory: /home/tmad109/.cache/pip/wheels/61/7e/90/bb69f24adcf75e3e86ef760d55df8f2bfc28abfc6f23667e5f
Successfully built q2studio
(qiime2-2017.10) [email protected]:/mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0$ npm install && npm run build
loadDep:uuid → addRemoteT ▀ ╢███████████░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░╟
WARN engine [email protected]: wanted: {"node":">=4.5.0"} (current: {"node":"4.2.6","npnpm WARN deprecated [email protected]: 🙌 Thanks for using Babel: we recommend using babel-preset-env now: please read babeljs.io/env to update!
npm WARN deprecated [email protected]: to-iso-string has been deprecated, use @segment/to-iso-string instead.
npm WARN deprecated [email protected]: Jade has been renamed to pug, please install the latest version of pug instead of jade
npm WARN deprecated [email protected]: Please update to minimatch 3.0.2 or higher to avoid a RegExp DoS issue
npm WARN prefer global [email protected] should be installed with -g
> [email protected] install /mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0/node_modules/pre-commit
> node install.js
sh: 1: node: not found
[email protected] /mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0
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npm WARN notsup Not compatible with your operating system or architecture: [email protected]
npm ERR! Linux 4.4.0-97-generic
npm ERR! argv "/usr/bin/nodejs" "/usr/bin/npm" "install"
npm ERR! node v4.2.6
npm ERR! npm v3.5.2
npm ERR! file sh
npm ERR! code ELIFECYCLE
npm ERR! errno ENOENT
npm ERR! syscall spawn
npm ERR! [email protected] install: `node install.js`
npm ERR! spawn ENOENT
npm ERR!
npm ERR! Failed at the [email protected] install script 'node install.js'.
npm ERR! Make sure you have the latest version of node.js and npm installed.
npm ERR! If you do, this is most likely a problem with the pre-commit package,
npm ERR! not with npm itself.
npm ERR! Tell the author that this fails on your system:
npm ERR! node install.js
npm ERR! You can get information on how to open an issue for this project with:
npm ERR! npm bugs pre-commit
npm ERR! Or if that isn't available, you can get their info via:
npm ERR! npm owner ls pre-commit
npm ERR! There is likely additional logging output above.
npm ERR! Please include the following file with any support request:
npm ERR! /mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0/npm-debug.log
(qiime2-2017.10) [email protected]:/mnt/3dgenome/projects/gut_metagenomics_thilini/qiime2/qiime2_moving_pictures_tutorial/q2studio-2017.10.0$
