I suppose one more odd things is the ASV length distribution:
table(nchar(getSequences(seqtab)))
##
## 270 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296
## 17 1 2 2 2 16 2 31 22 240 3 2 1 1 1 6 2 1 8 10 10 23 7 20 12
## 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321
## 31 13 20 80 25 67 43 397 102 175 191 322 296 468 122 219 87 105 127 291 375 547 162 121 157
## 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346
## 52 61 72 17 251 124 551 108 190 100 185 46 29 59 91 48 7 1 9 16 78 355 8 57 4
## 348 354 357 358 360 361 362 369 370 374 379 380 382 384 385 389 390 392 393 399 400 401 404 405 407
## 1 1 1 1 2 2 1 1 5 1 2 1 1 1 1 5 5 2 1 1 2 1 1 1 1
## 409 410 412 413 418 420 425 426 427 428 431 434 435 437 438 439 441 447 451 452 467 469 470 476 480
## 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 9 1 1 4 1 1 1 1 2 1 1 1 1
## 482 484 488
## 2 1 1
What amplicon are you targeting for this, does this much variation seem reasonable?